刑事诉讼职能管辖，又称部门管辖或者立案管辖，是指公安机关、人民检察院和人民法院之间立案受理刑事案件上的分工。

1、公安机关侦查的刑事案件

《刑事诉讼法》第18条第1款规定：“刑事案件的侦查由公安机关进行，法律另有规定的除外。”根据这一规定，除了法律另有规定外，公安机关是刑事案件的主要侦查机关。法律的这一规定是有其实际根据的：公安机关是国家的治安保卫机关，负有维护社会秩序、保卫国家安全的任务，它拥有庞大而严密的组织体系和足够的警力，专门的侦查手续和措施，具有良好的控制社会治安局势和快速反应的能力，并且在长期的同各种危害社会治安秩序的犯罪行为作斗争的过程中积累了丰富的经验。因此，将绝大多数的刑事案件交给公安机关侦查，便于发挥公安机关维护社会治安的作用。对于某些特定的刑事案件，法律规定由其他国家机关进行侦查。如人民检察院依法对其直接受理的刑事案件进行侦查;国家安全机关负责对危害国家安全的刑事案件进行侦查;军队保卫部门对军队内部发生的刑事案件行使侦查权;监狱对罪犯在监狱内犯罪的刑事案件进行侦查，等等。这些特定的刑事案件占整个刑事案件的比例是比较小的。

2、人民检察院直接受理侦查的刑事案件

《刑事诉讼法》第18条第2款规定：“贪污贿赂犯罪，国家工作人员的渎职犯罪，国家机关工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、报复陷害、非法搜查、侵犯公民人身权利的犯罪以及侵犯公民民主权的犯罪，由人民检察院立案侦查。”法律这样规定，一方面有利于检察机关集中力量对贪污、贿赂、国家工作人员的渎职等犯罪案件进行侦查，突出工作重点，加强反腐败斗争;另一方面有利于检察机关加强对公安机关侦查活动的监督。

根据检察机关是国家法律监督机关和公、检、法三机关分工负责、互相制约的原则，检察机关自侦查案件的范围，主要还是局限于国家机关工作人员利用职务的犯罪。除了上面提到的检察机关直接受理侦查的几种刑事案件以外，《刑事诉讼法》第18条还规定：“对于国家机关工作人员利用职权实施的其他重大的犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。”这不是一般的案件分类管辖划分的条款规定，而是检察机关根据法律监督职权对个案的监督条款，以纠正有案不立，有罪不究和司法实践中存在的腐败现象。这也不是检察机关包揽其他机关的侦查权，而是通过这种方式加强执法监督，促使其他机关严格执法，使所有犯罪都毫无例外地受到追究，维护国家法律的尊严和统一。